Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smok3bC0HKC9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms