Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm20547B8JJN0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20547B8JJN0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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