Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm6133B2RY53 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm6133B2RY53 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm6133B2RY53 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm6133B2RY53 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm6133B2RY53 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm6133B2RY53 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm6133B2RY53 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm6133B2RY53 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm6133B2RY53 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm6133B2RY53 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm6133B2RY53 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm6133B2RY53 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm6133B2RY53 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms