Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms