Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brpf3B2KF05 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms