Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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