Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CtcflA2APF3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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