Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Fam43bA2AM80 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Fam43bA2AM80 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Fam43bA2AM80 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Fam43bA2AM80 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Fam43bA2AM80 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms