Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms