Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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