Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms