Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ccdc194A0A140LIT1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc194A0A140LIT1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc194A0A140LIT1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc194A0A140LIT1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc194A0A140LIT1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ccdc194A0A140LIT1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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