Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
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