Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17190V9GX38 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms