Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm4T1NXB5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms