Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gria4Q9Z2W8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms