Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms