Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms