Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms