Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms