Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ror1Q9Z139 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms