Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sema4fQ9Z123 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sema4fQ9Z123 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms