Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf13bQ9WU72 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms