Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T2

Sae1, SUMO-activating enzyme subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sae1Q9R1T2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sae1Q9R1T2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms