Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms