Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ8

H2afy, Core histone macro-H2A.1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afyQ9QZQ8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2afyQ9QZQ8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms