Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 925 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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