Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms