Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcsk1nQ9QXV0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms