Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trpc5Q9QX29 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms