Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer2Q9QWW1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms