Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms