Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlr5Q9JLF7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms