Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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CtsmQ9JL96 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CtsmQ9JL96 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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CtsmQ9JL96 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CtsmQ9JL96 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CtsmQ9JL96 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CtsmQ9JL96 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CtsmQ9JL96 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CtsmQ9JL96 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CtsmQ9JL96 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CtsmQ9JL96 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CtsmQ9JL96 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CtsmQ9JL96 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CtsmQ9JL96 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CtsmQ9JL96 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsmQ9JL96 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms