Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FancaQ9JL70 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancaQ9JL70 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms