Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms