Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms