Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms