Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trim39Q9ESN2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trim39Q9ESN2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim39Q9ESN2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim39Q9ESN2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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