Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParvbQ9ES46 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms