Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rapgef4Q9EQZ6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rapgef4Q9EQZ6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rapgef4Q9EQZ6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rapgef4Q9EQZ6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rapgef4Q9EQZ6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms