Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms