Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Tspan4Q9DCK3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Tspan4Q9DCK3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Tspan4Q9DCK3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Tspan4Q9DCK3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Tspan4Q9DCK3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Tspan4Q9DCK3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Tspan4Q9DCK3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Tspan4Q9DCK3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms