Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufa8Q9DCJ5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms