Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne8Q9DC53 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms