Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms