Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms