Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms