Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Snx5Q9D8U8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Snx5Q9D8U8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Snx5Q9D8U8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Snx5Q9D8U8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Snx5Q9D8U8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Snx5Q9D8U8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Snx5Q9D8U8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Snx5Q9D8U8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Snx5Q9D8U8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Snx5Q9D8U8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Snx5Q9D8U8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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