Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7Q9D541 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms